Le point de blocage majeur de la ferme est la gestion de la santé animale. Depuis 2014, selon la volonté de Jean Baptiste Carrié, les antibiotiques ne sont plus utilisés. Il faut alors utiliser d'autres méthodes pour lutter contre les maladies. Tout se joue sur la prophylaxie.

• On note surtout des cas de grippes sur les veaux de 1 mois et demi. Des essais de kéfir (ici mélange d'herbes aromatiques et de champignons fermentés) sont fait pour prévenir l'apparition de la grippe.
• Des cas de diarrhées sont également présents. Une des solutions pourrait être un vêlage en extérieur avec une concentration de 5 vaches pour 8 ha afin de diminuer la pression microbienne.
• Enfin, une meilleure gestion des litières permettrait de limiter le développement des germes pathogènes.